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4月8日,来自剑桥大学和德国的研究人员在《国家科学院院刊》上发表了一篇题为“利用遗传进化网络分析新型冠状病毒”的研究报告,在互联网上引起了巨大反响。
根据本文,世界上感染的新型冠状病毒是不一样的,而是分为三种类型:甲、乙和丙。而且,这三种类型的病毒具有不同的全球分布。研究人员发现,最初出现在人类身上的新型冠状病毒的原始版本是A型。虽然它出现在武汉,但在武汉并不流行,但在美国和澳大利亚更常见。
这项研究引起了一段时间的热烈讨论,媒体上也出现了“最原始的菌株在美国很常见,变异菌株在中国武汉很流行”的结论。
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原始新型冠状病毒a型
在美国案例中更多
与以前的学术文章类似,剑桥大学的论文也是从遗传进化的角度进行的学术研究。
根据该论文,研究人员通过绘制2019年12月至今年3月4日新冠状病毒的遗传发展历史,发现了上述三种不同但密切相关的病毒类型;然后,通过在世界各地收集的160个基因样本,我们发现了不同类型的新型冠状病毒的全球传播。
具体而言,由中国武汉病毒学研究所的石团队发现的与新型冠状病毒(即batcovratg13病毒)具有96.2%同源性的蝙蝠冠状病毒被确定为动物中新型冠状病毒的祖先。然后,以此为参照,根据进化关系,将从gisaid数据库中提取的160个新的冠状病毒基因分为三类:A型、B型和C型..
其中,与蝙蝠冠状病毒最接近的是A型新型冠状病毒,它也被研究人员认为是在人类中传播的“原始”型新型冠状病毒。然而,科学研究表明,虽然这种A型新型冠状病毒在武汉出现并感染了5名武汉人,但在广东也发现了4例,但在武汉、中国甚至东亚发现的更多的是A型新型冠状病毒的变体,即B型新型冠状病毒。
A型病毒在美国和澳大利亚病例中发现较多,其中早期美国病例有在武汉生活和旅游的历史。另一种丙型病毒是乙型病毒的变种,广泛存在于中国和东亚。然而,研究人员说,在他们研究的160个基因样本中,在中国大陆没有发现丙型肝炎病毒。这种病毒在欧洲出现得更频繁,在新加坡、香港和台湾也有发现。
换句话说,仅从这篇文章来看,尽管武汉出现了最原始的新型冠状病毒,但它并没有在当地传播。相反,B型变异体从A型传播到武汉,然后传播到中国其他地方和东亚的许多地方。目前,甲型流感真正传播的地方似乎是美国和澳大利亚。传播于欧洲的丙型肝炎是广泛出现于中国和东亚的乙型肝炎的变种。
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这种病毒的来源还有待进一步证实
对于大多数中国人来说,人们更关心的是这项研究能否给出病毒来源的答案——特别是,既然最初的甲型流感病毒并没有在中国传播得更多,而是在美国出现得更多,这是否意味着病毒起源于美国?
对于这个问题,该论文的第一作者、剑桥大学的彼得·福斯特博士在接受媒体采访时说,不管是哪篇论文,对于病毒的来源仍然没有明确的答案。然而,研究中发现的证据表明,人类感染新型冠状病毒的初始时间大致为2019年9月13日至2019年12月7日,这是根据中国病毒的突变速度计算出来的。
至于为什么甲型流感病毒没有在武汉和中国大规模出现,而是作为甲型流感病毒变种的乙型流感病毒引起了严重的传播?彼得·福斯特博士的反应是,甲型有可能变异成乙型,因为它不适应当地的免疫系统。至于为什么甲型流感在美国和澳大利亚出现得更多,他认为这也是可能的,因为甲型流感更适合那里的人的免疫系统。
那么,这些发现意味着什么?在英国剑桥大学的报告中,研究人员表示,他们的发现可能有助于各国沿着这些渠道发现未记录的传染源,并预测下一次疫情可能来自何处,从而更好地对这些传染源采取隔离措施,避免疫情再次蔓延。
到目前为止,关于新型冠状病毒发源地的消息还没有明确的结论。4月10日,国家卫生计生委高级专家组成员、中国疾病预防控制中心流行病学首席科学家曾光教授接受媒体采访。在谈到海外疫情时,他还说:“如果疫情得不到控制,只能说明两个问题:第一,除了武汉,可能还有其他来源。我们没有找到它,也许有国外。”
4月5日,国家卫生计生委高级专家组组长、中国工程院院士钟南山在接受媒体采访时指出,病毒的来源尚未定论,目前业界存在各种各样的意见。“疫情发生在武汉,这是事实。它的起源意味着这种病毒的上一代在哪里。现在有一些数据显示,在美国和意大利,2019年也有类似的情况。它们(与疾病传播的现状)有什么关系?只需要大量的病毒分子生物学或进化树,经过科学训练的人就能搞清楚。所以到目前为止,没有人能得出任何结论。”
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病毒可追溯性研究正在世界各地展开
虽然结论不明确,但国际社会正在努力探索疫情的来源,相关学术成果不断发表。
3月17日,澳大利亚悉尼大学的罗伯特·加里、爱德华·霍姆斯、美国斯克里普斯研究所的克里斯蒂安·安德森和英国爱丁堡大学的安德鲁·兰鲍特曾在英国权威杂志《自然医学》上发表文章。新型冠状病毒的变异并不是在动物体内完成的,而是在从原始宿主向人类传播后,通过重复和小规模传播而形成的,这可能需要几年或几十年的时间。当然,这并不排除在动物间传播时突然变异的可能性。
作者之一,杜兰大学医学院的罗伯特·加里教授在接受美国广播公司采访时说:“我们的分析和其他一些分析指出了比这更早的起源。”武汉肯定有一些病例,但这绝不是病毒的来源。在累积到现在的情况之前,这种病毒的弱版本已经在人群中传播了数年甚至数十年。武汉那个市场肯定有病例,但这不是病毒的来源。”
2月底,中国科学院西双版纳热带植物园副研究员于与华南农业大学和北京脑科中心的研究人员共同发表了关于中国新型冠状病毒的发源地等问题的重要研究论文。通过基因分析,研究小组发现,这种新型冠状病毒在华南海鲜市场是从其他地方进口的。华南海鲜市场不是新型冠状病毒的发源地,而是引爆点。
此外,美国国家卫生研究院院长弗朗西斯·柯林斯在他的博客文章中提出了关于病毒来源的两个观点。第一个想法是,随着新的冠状病毒在其天然宿主(可能是蝙蝠或穿山甲)中进化,它将感染人类细胞。第二个想法是,在获得引起人类疾病的能力之前,病毒已经从动物进入人类。经过几年甚至几十年的逐渐进化,它们终于获得了在人与人之间传播的能力,并能导致严重的疾病。
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剑桥大学发表了一篇论文:新型冠状病毒的原始版本在美国和澳大利亚很常见
最近,剑桥大学的一篇论文再次向全世界的人们展示了新冠状病毒的早期起源及其进化传播途径的谜题。
根据发表在《美国国家科学院院刊》(pnas)上的这篇论文,新型冠状病毒分为三类:A类、B类和c类。其中,A类是病毒爆发的根源,它集中在美国和澳大利亚的感染者中。中国武汉只有少数甲流病例;乙类菌株来源于甲类,主要分布在中国(武汉)。研究人员认为,丙型肝炎是由乙型肝炎演变而来的,乙型肝炎是欧洲受感染人群的主要类型,在亚洲的香港、新加坡和韩国也存在。
如何研究这个结论?根据该论文,从2019年12月24日至2020年3月4日,来自英国剑桥和德国的研究人员收集并测序了来自世界各地的COVID-19肺炎患者的160个完整基因组数据(sars-cov-2病毒),并通过绘制原始基因图谱关系构建了该病毒的基因组发育网络。
自疫情爆发以来,病毒的来源和传播途径一直是全球科研界关注的焦点。尽管谣言很多,但是如果没有科学研究人员收集详细的数据并进行分析,任何指责武汉是病毒来源的理论都是没有根据的。
剑桥大学的研究人员首次将系统发育方法应用于病毒学,这显然有助于追踪新型冠状病毒感染的进化。
“突变如此之多,以至于我们无法精确追踪新的冠状病毒家族。但是我们使用了数学网络算法来可视化地图树。”该论文的作者、剑桥大学遗传学教授彼得·福斯特博士说。研究小组认为,之所以能顺利追踪,是因为他们使用了dna绘图技术,这是一种追踪人类迁徙历史的早期技术。
本文详细解释了该病毒是否起源于中国武汉。
福斯特博士和他的研究小组发现,甲型流感病毒不是武汉的主要病毒类型,武汉只有少数甲型流感病例,而武汉甲型流感病毒的源头实际上是居住在这个城市的美国人。
在武汉传播的主要病毒属于乙类,在东亚各地的患者中流行。该小组强调,通过研究亚洲以外的病毒,发现由甲类转化而来的乙类病毒并没有传播到东亚以外的地方,似乎与其他地方有“冲突”。
据该小组称,a类病毒与从蝙蝠和穿山甲中提取的病毒最相似,因此他们得出结论,a类病毒是此次疫情的根源。
丙类病毒是欧洲感染者携带的主要病毒,在法国、意大利、瑞典和英国的早期患者中发现。研究指出,丙型肝炎病毒不是在中国大陆的样本中发现的,而是在新加坡、香港和韩国的样本中发现的。
至于意大利,这是一个主要的感染地区,该小组也有后续研究。该报指出,新的分析还显示,首次进入意大利的病毒于1月27日首次在德国感染者中被记录,意大利的另一条早期感染途径与“新加坡集团”有关。
剑桥大学的科学家认为,新型冠状病毒是在9月中旬至12月初首次在人类中感染和传播的。他们认为,基因传播追踪技术可以应用于最新的冠状病毒基因组测序,甚至有助于预测未来全球疾病传播和激增的热点。
福斯特说:“系统发育网络分析可能有助于确定新的冠状病毒感染的未经证实的来源,然后它可以被隔离,以遏制疾病在世界范围内的进一步传播。”
来源:人民视窗网
标题:英德研究者溯源新冠病毒:A类集中出现于美国和澳大利亚
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