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新华社北京2月1日电(记者魏)北京大学和清华大学联合研究小组近日在国际权威学术期刊《中国科学院院刊》上发表论文,称其开发了一种新的转录组测序快速数据库构建方法“雪莉法”。据研究小组称,这种方法大大简化了数据库构建过程,可用于单细胞转录组的高质量测序,并有望显著提高包括新型冠状病毒在内的样品的测序质量和速度。

我国科学家开发出转录组快速建库新方法 有望助力新型冠状病毒测序

Rna是生物细胞、某些病毒和类病毒中存在的遗传信息的载体。目前,rna测序技术已广泛应用于绘制物种转录组图谱和研究疾病的分子调控机制。众所周知,不同的研究需要不同的rna扩增方法,但最常见的扩增方法是复杂和耗时的。痕量样品的检测也面临许多技术挑战。

我国科学家开发出转录组快速建库新方法 有望助力新型冠状病毒测序

研究人员发现,广泛应用于dna测序和数据库构建技术中的tn5转座酶可以直接作用于rna/dna杂交链,从而消除了传统rna数据库构建技术中扩增等必要但繁琐的操作步骤,避免了预扩增带来的偏差。这种基于tn5转座酶的转录组测序快速数据库构建新方法被命名为“雪莉”。

我国科学家开发出转录组快速建库新方法 有望助力新型冠状病毒测序

据课题组成员北京大学黄教授和清华大学研究员介绍,实验结果表明雪利酒数据库质量较好,碱基序列的均衡率较高,操作过程简单。整个过程只需5个步骤,在试管中只需4小时左右即可完成,人工操作时间不到半小时,大大节约了实验成本。

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该研究小组的专家、北京大学生物医学前沿创新中心主任谢晓亮教授表示,这种新方法得到了广泛应用,首次临床应用是对感染新型冠状病毒的人的样本进行测序。与现有的rna测序和数据库建立方法相比,"雪莉"更灵敏、更简单,这对检测和分析非常重要。

我国科学家开发出转录组快速建库新方法 有望助力新型冠状病毒测序

“我们的团队目前正夜以继日地工作,希望能为新型冠状病毒提供更好的测序方法,并满足流行病预防和控制的需要。”谢晓亮说。

[我想纠正错误]负责编辑:庞博

来源:人民视窗网

标题:我国科学家开发出转录组快速建库新方法 有望助力新型冠状病毒测序

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